Desde el EMDR se entiende que son las experiencias traumáticas del pasado o del presente los que han contribuido al desarrollo de la patología o del trastorno que presenta el paciente.

Tenemos un sistema innato fisiológicamente orientado a elaborar las experiencias que vivimos. La patología se crea cuando este sistema innato se bloquea y el recuerdo del hecho traumático se queda aislado del resto de la red neuronal de la persona y no se integra con el sistema innato que empuja a cada uno hacia la autocuración.

Por ello, en EMDR es el recuerdo traumático lo que se trata terapéuticamente mediante la estimulación alternada de los dos hemisferios cerebrales mientras se recuerda la imagen traumática, la cognición negativa a cerca de nosotros mismos vinculada al trauma, las emociones perturbadoras que despierta la imagen y las sensaciones físicas.

De esta manera, se da una transmutación de esas experiencias almacenadas de modo disfuncional hacia una resolución adaptativa que favorezca la salud psíquica y promueva la alegría.